사하라 사막을 경유하던 여객기가 연달아 괴로봇에 의해 습격 받아 추락하는 사건이 일어난다. 이에 지구방위대에서 조사를 요청받은 윤박사와 남궁박사는 각각 로봇태권v와 황금날개 3호를 출격시킨다. 실은 이 사하라 사막에 위치한 바벨탑은 실은 오미크론별 우주인이 지구정복을 위해 설치한 대형 기지로서, 그 안의 대형 컴퓨터는 자유자재로 변신 하는 뮤탄트, 하늘을 나는 괴물 피닉스, 로봇 타이탄을 이끌고 바벨탑의 정체를 숨기기 위해 그 곳을 지나는 비행기를 격추시킨다. 대형 컴퓨터는 태권브이와 황금날개가 위험 요소라고 판단하고 둘을 갈라놓기 위해 황금날개로 변신한 뮤탄트는 훈이를 공격하여 큰 부상을 입힌다. 이 일로 인해 태권브이 측과 황금날개 측이 오해가 생기지만 황금날개 1호인 현의 노력으로 오해를 풀고 바벨탑으로 향한다. 그러나 대형 컴퓨터의 3시종의 힘이 대단하여 태권브이와 황금날개는 위기에 몰리게 되지만 일행은 힘을 합쳐 적을 물리치고 지구를 향해 날아오던 오미크론 별 우주선들도 자신의 별로 돌아간다.