프랑스와 영국, 스페인간의 이권다툼으로 어지러웠던 시기 17세기 유렵... 프랑스는 교회의 권위를 앞세워 총사대를 해산시키고 왕권을 약하게 만든 추기경의 세력에 의해 조금씩 지배되고 있었다. 그러던 어느날, 프랑스의 작은 마을에 검은 복장을 한 검객이 나타나 추기경에 반기를 든 총사들을 하나 둘씩 제거해 나간다.
눈 앞에서 총사였던 아버지의 참혹한 살해 현장을 목격한 달타냥이란 꼬마아이는 그 후 아버지의 복수를 위해 죽은 아버지의 친구이자 스승인 플랑셰와 함께 세계 각국을 돌아다니며 검술과 무예를 연마하기 시작한다.
그 후 모험심이 강하고 정의를 중시하는 건장한 청년으로 성장한 달타냥은 20세가 되던 해 오랜 숙원이었던 아버지의 원수를 갚고자 플랑셰와 함께 파리로 향한다.

한편, 루이13세의 프랑스는 왕권이 더욱 더 약해지고 그 대신 추기경 리슐리외의 권한이 높아진다. 추기경은 최고의 검객이자 사악한 악당 페브르와 손을 잡고 총사대의 해산과 주변국들과의 분쟁을 야기시켜 아예 프랑스를 자신의 통치하에 둘 계략을 세우고 왕권의 몰락과 프랑스의 혼란을 위해 혼신의 노력을 다한다.
그러던 중 평화회의를 위해 프랑스에 오게 된 스페인 평화 사절단은 리슐리외 추기경이 파 놓은 덫에 빠지게 되고 이 사건으로 파랑스와 스페인의 관계는 악화되어 루이13세는 큰 위기에 놓이게 된다.

파리에 도착한 달타냥은 세명의 총사들을 만나게 되지만 총사대의 기개와 며예를 상실한 채 허풍만 늘어놓고, 충동적이며, 술고래들인 이들의 겉모습에 실망하게 되고, 그들 역시 자기중심적이고 충동적인 달타냥에 큰 호감을 갖지 못한다.
한편, 추기경의 음모와 탄압으로 인해 총사대는 모두 뿔뿔이 흩어지고 총사대장은 감옥에 갇히게 된다. 달타냥과 플랑셰는 망연자실한 총사대를 대신해 총사 대장을 구하러 성에 침입하고 그 계획을 알게 된 삼총사는 이들과 함께 총사대장을 구하게 된다. 그 후 네 명은 총사대의 부활과 왕권의 부활을 위해 추기경에 대항하는데...